造成这场灾难的是一种名为生命树的植物，它拥有着改造生命和完全拟态的能力，在脱离了那个秘密结社的控制后就钻入地下开始重新成长发育，最初受到它改造影响的是那些植物，这种影响起初是无害的，甚至还在帮助其他植物成长的更加茁壮，让作物的产量变得更高。
有些科学家好奇导致植物产生变化的诱因，想要搞清楚这种变化是否对人类存在危害性，但更多的人却在欢庆着迎接下一个千年的到来，却从未意识到灾难已经在他们脚下的大地中扎下了根系，并已经与他们身边的植物完成了融合——就连那个秘密结社也没有将植物的变化与他们丢失的收容物联系起来。
按照假面少年口中的学者们推测，生命树最起码是经历过两次蜕变后才开始对人类展现出攻击性，在逃脱收容后它扩展根系与地表植物的根系建立共生共存的关系，绕开了各大秘密结社的监控通过汲取着这些植物们供给的微弱营养完成了第一次蜕变，接着开始反哺这些植物，目的一是为了让这些植物生长的更快更好然后汲取更多的营养来供养自己，二是在反哺的过程中可以持续同化、改造这些植物，使得最初的这一批魔化植物成为了生命树耳目的同时，也开始悄然入侵地球生态圈。
最初的这一批魔化植物并不具备任何的攻击手段，它们在生命树的影响下枝叶变得更加繁盛，果实更加鲜美，生命树仅仅只是在传播和繁衍后代方面对它们进行了微不足道的改造和同化，草籽、果实、孢子这些植物本来用于传播和繁衍后代的手段被生命树当成了向全世界传播、复制自己的手段，借由此手段它开始同化改造食草动物，食草动物在吃下它们后会受到生命树力量的影响，由内向外得受到生命树的微弱改造和同化，并以此为跳板进一步改造同化肉食动物。
不知不觉间整个地球的生态圈都在受到生命树的悄然渗透，人类当然也不能例外。
当生命树的根系扎根到地核附近，整个地球的生态系统也被生命树改造的七七八八时，终于被全球各国、隐藏在人类社会中的秘密结社等明里暗里多方势力发现异常时，灾难已经完成了漫长的酝酿，并且一夜之间改变了人类的世界。
“巨大的植物根系撕裂了人类浇筑出的水泥大地参天巨树拔地而起，魔化植物和生命树拟态改造过的仆从向人类露出了獠牙，它们就潜伏在人们的身边马路两旁的绿化带，天上飞过的小鸟，