命运灵蕴残页在命运灵蕴迷谷，这里命运灵蕴脉络交织，遍布吞噬一切的漩涡。他们多次遇险，最终在最深处找到残页。
灵蕴平衡宝玉在灵蕴失衡炼狱，这里灵蕴灵液失衡引发风暴。他们与守护者沟通后，用调和装置多次调整能量，修复故障仪器，恢复平衡，拿到宝玉。
带着三件圣物回到灵蕴灵殿，灵殿吸收后力量觉醒。灵蕴掠夺者派出灵蕴暗影生物抢夺，这些生物有的像黑色灵蕴晶体，能瞬间灵蕴化物体，有的像暗影火焰，污染灵蕴灵液。
九儿和青年与灵蕴灵殿并肩战斗。青年操控飞船用脉冲炮攻击，灵蕴暗影生物借混乱空间和紊乱灵能躲避。青年分析其规律调整策略。九儿持星辰灵蕴之杖念咒，释放净化之光，观察战场找弱点。灵蕴灵殿释放护盾并发射震荡波，与敌人碰撞引发爆炸。
战斗白热化时，青年发现灵蕴暗影统领，驾驶飞船发射导弹，被其灵蕴混沌屏障挡住。九儿借助灵殿之力，用星辰灵蕴之杖发出净化光柱打破屏障。青年抓住机会，发射毁灭光束，贯穿统领核心将其消灭。
其他灵蕴暗影生物大乱，九儿和青年乘胜追击，成功守护灵蕴灵殿。灵殿称赞他们拯救了宇宙基础秩序，鼓励继续探索。