朱能说道：“陈氏父子暗地招兵买马，恐怕有异心。”
刘俊问道：“那现在该如何是好？”
朱能说道：“你先进一步观察观察，善后之事听朝廷的。我给你还留了一营辽东步兵和部分海军舰只，配合你们震慑安南。”
当天，朱能就带领辽东军主力急匆匆地班师，只给安远侯柳升留下一营勉强完好的步兵和三艘战舰，配合刘侍郎和刘参政善后。但是被留下来的“广宁号”破损严重，还不能出远门，几乎失去作战能力。
北返途中，朱能病情日益恶化，开始发起了高烧。
随舰的李济等军医轮流尝试用鸡素子、艾叶水等古方对朱能进行诊治，毫无效果。
“辽王爷，我的好兄弟，真是对不住了……”
朱能心情越来越差，清醒的时候也学当年收钱在伊犁的故事，给辽王写了份遗嘱，表达了后悔和歉意。
不过写好之后，他又觉得这些后悔和道歉很多余，很可笑，最后将之撕碎，扔到了海里。
十一月十二日，朱能一行抵达东海舰队驻地澎湖妈宫港进行休整，顺便请浙江水师对船只进行应急维修，主要是修补破损的船帆。
朱能听说到了澎湖，强提精神让千户马欢扶着他登上了妈宫岛，闲聊了一阵。
“马千户，你觉得此次南征是否算是胜利？”
“那是当然，辽东军所向披靡，前后斩俘十六万多人。如果不是这该死的台风和瘴气，我辽东军一人一船也不会折损，那些俘虏都拉回辽东各地开矿、种田去。将军放心，回去等着恢复侯爵就是了，说不定皇上一高兴，要晋封你为国公哩！”
“一将功成万骨枯，且不说云南都司的损失，光说海军官兵伤亡这么大，我朱能何德何能到京城接受封赏？还是回辽东去吧。”
“将军多虑了，此次收复交趾故地，与新王收复西域故土比肩，必将名垂青史。”
“我派养丰等人进驻富春城，本是提前布下一子，待收复安南后，再乘胜将占城一体纳入大明。可惜天意如此，只能是虎头蛇尾。”
“将军深谋远虑，让人叹为观止！”