俺答在青海向达赖三世许愿回来后，开始和三娘子共同主持修建弘慈寺，也就是大召寺，两年后竣工，并花费巨额白银铸成一尊巨大的释迦牟尼佛像，由达赖三世亲自前来开光后供奉在寺内。在修建归化城时，俺答已经进入老年，并且疾病缠身，三娘子积极辅佐丈夫处理各种事务。
俺答去世，三娘子率俺答长子辛爱黄台吉等告讣关吏，并呈文明廷，贡白马九匹，镀金撒袋各一幅、弓一张、箭十五支，以示继续忠顺。明廷派遣使者祭吊如礼，当时奉表称谢者，皆以三娘子为主名，凡赴内地均须携带三娘子签发的文书，方准通行。三娘子一跃成为土默特集团中的核心人物，“群情依为向背”，她地位的变化与北方地区的治乱息息相关。神宗听从廷臣建议，赐三娘子大红五彩纻丝衣二袭、彩缎六表里、木棉布二十匹，三娘子与明朝廷的关系更加密切。
俺答初殁，黄台吉想要依照当时风俗，以收继婚的形式娶三娘子为妻，她时年三十二岁，嫌黄台吉老病貌丑，不愿再嫁，遂率众远遁。黄台吉明白，若不与三娘子成婚，很难入承王位，统辖诸部，于是轻骑追逐三娘子。时当贡市日期，顺义王位悬而未决，贡市迟迟未结，郑洛深知三娘子对于明蒙关系的重要性，于是遣使劝三娘子说：“夫人能归属顺义王，则不失朝廷的恩宠，否则不过是塞上的一个妇人而已。”三娘子顾全大局，最终同意与黄台吉成婚，明蒙贡市恢复如旧。
黄台吉继承父位后，经常埋怨其父亲不该与明朝议和，欲挑起事端，三娘子予相劝说：“天朝所以待我者甚厚，岁通贡市，坐享全利，而无后忧。孰与夫冒矢石，出万死，幸不可知掠获也。”黄台吉听后非常信服，从此打消了与明朝开战的念头。
不久后，三娘子因其子的婚姻问题与部落内部发生纠纷，三娘子派遣精锐骑兵迅速包围了板升城，爆发了板升之战。三娘子军斩杀80余人，生擒20人，缴获盔甲30副，驼马100多匹，战事持续了5个多月，最终降服了板升城。